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本发明公开了一种抗病相关蛋白GaRPL18及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白质是如下a)或b)或c)的蛋白质：a)氨基酸序列是序列3所示的蛋白质；b)在序列3所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质；c)将序列3所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有相同功能的蛋白质。通过实验证明：本发明利用基因沉默技术获得的GaRPL18沉默棉花对黄萎病菌的抵抗能力下降，而通过过表达方法获得的转GaRPL18基因拟南芥则表现出对黄萎病菌的明显抗性。说明GaRPL18参与了棉花对病原菌及真菌的防御反应，是一种重要的参与棉花天然免疫反应的基因。